南通體視顯微鏡的使用相對比較簡單。將所要觀察的標本放在載物台上—如果是活體標本，則可以將其放在玻璃培養皿內。若要觀察標本，隻需打開南通體視顯微鏡上的光源並調節目鏡，就可以通過顯微鏡進行舒適的觀察。另外不用像諸如正置/倒置顯微鏡那樣更改物鏡倍率，也可以通過調節變倍進行高倍觀察。