南通體視顯微鏡使用兩個光路，不同於複合顯微鏡隻有一個光路。南通體視顯微鏡的兩個目鏡可以從兩個不同角度傳輸樣品圖像，由此獲得的三維視圖讓您能夠感知諸如卵或胚胎等較厚樣品的深度和尺寸。

在低倍率應用中，南通體視顯微鏡可以對肉眼可見的對象進行高質量的3D觀察。在生命科學應用中，體視顯微鏡可以用來觀察昆蟲或植物。另外由於非常適合用於生物解剖，其通常還被稱為解剖顯微鏡。